La primera de las áreas tendrá una superficie de 11.956 metros cuadrados y está situada en la zona portuaria más septentrional, coincidiendo con el pantalán. Pretende satisfacer el tráfico de graneles sólidos. Mientras tanto, el plan admite un uso comercial provisional.

La zona dos comprende el cuarto y último tramo del dique de abrigo actual y la prolongación del mismo. En sus 88.353 metros cuadrados se moverá mercancía general, graneles sólidos y líquidos. Además, comprende un uso complementario para empresas cuya actividad esté ligada a la porturia.

El área tres, de 122.250 metros cuadrados, la constituye la franja de separación entre la zona de operaciones del Muelle Norte y la playa, por parte del acceso al pantalán y por parte del relleno adosado a la dársena pesquera. Según el plan, la previsión es de uso público, pero se permite hasta entonces un uso comercial y específico de mercancía general.

La zona cuatro tiene una superficie de 186.617 metros cuadrados. Comprende parte del dique existente, parte de la zona de relleno, el Muelle Norte y su continuidad por el Muelle Centro hasta la prolongación del lateral de la nave de fundición hasta el mar. Se ha propuesto uso básico mixto comercial y complementario.

El área cinco cuenta con 24.182 metros cuadrados, y está constituída por la dársena pesquera y superficies adyacentes, con lo que se dedicará a uso pesquero.

La siguiente zona es la más extensa, ya que cuenta con 407.846 metros cuadrados.

Comprende parte del Muelle Centro y el Muelle Sur actual, incluyendo la concesión de Marvalsa y una pastilla al oeste, lindando con la planta de Fertiberia. Se ha propuesto como uso básico el mixto comercial, y como específicos los de graneles y mercancía general. La Autoridad Portuaria se ha comprometido a no autorizar en el Muelle Centro el uso de sustancias peligrosas que podrían incurrir en situaciones graves de peligro.

El área siete tiene 67.954 metros cuadrados, y está ocupada por la fábrica de Fertiberia, con lo que se le dará un uso industrial.

La octava zona comprende la ampliación ya iniciada del puerto de Sagunto. Tendrá tráfico de mercancía general y graneles sólidos y líquidos. Queda abierta la posibilidad de que se establezcan empresas vinculadas a la actividad portuaria como las logísticas, reparación o construcción de buques, industrias relacionadas con el tráfico marítimo, etc.

El área nueve tendrá 49.997 metros cuadrados. El plan de usos la contempla como espacio de reserva.